Forscher versuchen zu Studie unterschiedliche microbiomes effektiver

Wir wissen, dass Faser ist gut für uns und ist ein wichtiger Teil unserer Ernährung. Ein Weg, um mehr Ballaststoffe in unserer Ernährung ist Faser ergänzt, und, wenn, die wir nehmen, Faser-Ergänzungen, die unser mikrobiom wird, uns zu lieben.

Aber tun Sie Faser Ergänzungen wirklich einen Unterschied machen, um unser mikrobiom? Die Tatsache ist, dass jeder das mikrobiom ist anders. Jeder von uns hat mehr als 100 verschiedene Arten von Bakterien in unserem mikrobiom, und eine person, die Bakterien unterscheidet sich wesentlich zu anderen person der Bakterien. Nicht verwandten Menschen zu teilen, nicht mehr als 30% der gleichen Bakterienstämme.

Die Vielzahl von Bakterienstämmen gefunden in der mikrobiom-macht es schwierig, zu studieren. Isolieren Sie alle der Bakterien in nur einer person mikrobiom kann zwei Monate von Arbeit, und das ist, bevor alle Experimente, die auf diese Bakterien werden selbst durchgeführt.

Um dieses Problem zu bekämpfen, Lawrence David, zusammen mit dem mittlerweile zurückgetretenen David-lab-Mitglieder Max Villa und Rachael Blüte, entwickelte eine experimentelle Plattform, genannt MicDrop Kultur und assay-Darm mikrobielle Funktion für Hunderte von verschiedenen Mikroben auf einmal. Dies ermöglicht Ihnen, zu analysieren, Dutzende von Bakterien der Gattung in die individuelle mikrobiom, die in einem einzigen Tag. “Wir wissen, dass das Darm-mikrobiom ist von enormer Bedeutung, die menschliche Gesundheit,” Bloom sagte. “Ein Weg, um zu Messen, wie jemand das mikrobiom-reagiert auf eine Behandlung—ob ein Medikament, probiotischen oder präbiotischen—ist wirklich wichtig.” Ihre Arbeit wurde veröffentlicht in mSystems am 30.

Die Plattform nutzt Blasen zum isolieren von Bakterien. Machen die Blasen, Sie mischen der Bakterien mit Wasser und öl. Es ist ein bisschen wie Salat-dressing. Wenn Sie shake-Salat-dressing, um das öl und Wasser zu mischen, die Sie erstellen Blasen, da Wasser und öl nicht mischen. In MicDrop, diese Blasen Kapseln von Bakterien. “Weil die Blasen sind getrennt”, sagte David, “Sie eigentlich am Ende wird wie kleine Petrischalen.” Das team kann dann wachsen die Bakterien in diesen Blasen, und führen Sie die resultierende Kultur material durch DNA-sequencer zu entdecken, was die Bakterien in die Blasen und wie viele.

Als proof-of-concept, die Sie gemessen, wie gut die Bakterien verdauen konnten verschiedene Nahrungsergänzungsmittel aus dem Supermarkt. “Wir wussten nicht, wie die fiber supplements beeinflussen unterschiedliche Menschen”, sagte David. “Wir haben uns gefragt, ob jeder Mensch hat Bakterien, verbrauchen die Ergänzung und wenn ja, haben Sie eine viel oder wenig?”

Sie verwendet MicDrop um diese Frage zu beantworten. Sie Gaben Mikroben eine speziell entwickelte Nahrung. Nur die Mikroben, die in der Lage sind zu wachsen auf, dass die Ernährung vermehren. “Dann werden wir verändert die mikrobielle Kultur-medium zu sehen, welche Mikroben beeinträchtigen könnte dieses neue Ballaststoffe,” Villa sagte. Jede der neun Menschen, die Sie getestet hatten Bakterien, die Aussehen wie Sie verdauen konnte, die Ergänzungen, aber die Anzahl dieser Bakterien variiert.

“Traditionell, Mikrofluidik hat ein Haus in engineering labs” Villa sagte, “aber unsere Technik ist einfach genug für ein breiteres Publikum von Forschern.”