Bei der Erforschung von Morbus Crohn, einer entzündlichen Erkrankung des Magen-Darm-Trakt, eine Herausforderung ist die Trennung mögliche Ursachen für die von der Flut für die systemische Entzündung, die in der Bedingung. Forscher unter der Leitung von Subra Kugathasan, MD veröffentlichte vor kurzem eine Analyse, die Ausgrabungen unter dem Zeichen der Entzündung, in dem bemühen, zu bewerten, mögliche Ursachen.
Graduate student Hari Somineni, Kugathasan s lab, zusammen mit Emory und Georgia Tech Genetiker für einen anspruchsvollen Ansatz, der fand einige gold-nuggets, die in den entzündlichen Kies. Die Ergebnisse wurden in der Zeitschrift Gastroenterology.
Die Gruppe untersuchte DNA-Methylierung in Blutproben von pädiatrischen Patienten mit Morbus Crohn, die sowohl bei Diagnose und nach der Behandlung und follow-up. Die Informationen kamen aus Blutproben von 164 Kindern mit Morbus Crohn und 74 Kontrollen, die als Teil des RISIKO-Studie, unterstützt durch die Morbus-Crohn-& Colitis Foundation und Kugathasan führt.
“Unsere Studie betont, wie wichtig es ist, zu tun längs-Profilierung, schauen sich den Patienten vor und nach der Behandlung, anstatt einfach nur einen Querschnitt,” Somineni sagt.
DNA-Methylierung ist ein dynamischer Prozess, der Einfluss der molekularen Phänotypen von komplexen Krankheiten durch drehen des Gens(s) on oder off. Die Forscher beobachteten, dass die gestört methylierungsmuster zum Zeitpunkt der Diagnose in der pädiatrischen Morbus Crohn-Patienten zurückgegeben zu denen ähneln Kontrollen nach der Behandlung von Entzündungen.
Kugathasan ist Marcus professor für Pädiatrie und Humangenetik an der Emory University School of Medicine und Children ‘s Healthcare of Atlanta und Direktor des Children’ s Center für die Transplantation und Immun-vermittelte Erkrankungen. Somineni ist in der Genetik und Molekularbiologie graduate-Programm, mit einem Ph. D.-Abschluss voraussichtlich im Mai 2019.
Co-Autoren gehören Suresh Venkateswaran Ph. D., Alicia Smith, Ph. D., Karen Conneely Ph. D., und David Cutler, Ph. D. an der Emory; und an der Georgia Tech, Greg Gibson, Ph. D.
Die überwiegende Mehrheit der Krankheit-assoziierte Methylierung Veränderungen im Blut”, sind eine vorübergehende Folge der Entzündung und somit die Folge der Krankheit,” die Autoren schreiben. “Was wir sehen ist, dass die Behandlung der Entzündung-Signaturen kann grundsätzlich die Behandlung der Symptome der Crohn-Krankheit eher als die Ursache.” Sie fügen hinzu: “Dies kann zumindest teilweise erklären, warum der Crohn-Krankheit bleibt oft eine lebenslange remittierender und rezidivierende Erkrankung, die trotz wirksamer Behandlung der Entzündung die Symptome.”
Beachten Sie: die Proben stammten aus dem Blut der Patienten, nicht Ihr Darm. Es macht also Sinn, dass die Gene in den weißen Blutkörperchen sind vor allem die Informationen über den Grad der systemischen Entzündung, die ist reduziert auf eine erfolgreiche Behandlung. Die Entnahme von Proben von intestinalen Gewebe oder von Zellen des Immunsystems befindet sich im Darm geben könnte ein anderes Ergebnis, Somineni sagt.
Der Forscher in einem “Mendelian randomization” – basierte Analyse, um zu umreißen-methylierungs-änderungen, die dazu beitragen kann, oder die Folge von Krankheit. Dieses erlaubt Ihnen, zu Gestrüpp entfernt die Entzündung zu offenbaren-methylierungs-änderungen, die möglicherweise zugrunde liegen, die Entwicklung der Krankheit; diese Methylierung änderungen werden zur Vermittlung des genetischen Risikos einer bekannten non-coding-Variante (single nucleotide polymorphism oder SNP). Die Integration der Methylierung von Daten mit der vorhandenen genetischen Informationen weist auf die gene RPS6KA2, Kodierung der ribosomalen protein-S6-kinase-A2 – gen, dass Somineni Pläne, um weiter zu untersuchen.