Erste große Studie von Proteinen bei Patienten mit akuter lymphatischer Leukämie

Die häufigste form von Krebs im Kindesalter ist die akute lymphoblastische Leukämie (ALL). Forscher an Lund-Universität in Schweden, in Zusammenarbeit mit dem Karolinska Institutet, SciLifeLab und der University of Cambridge haben nun die umfangreichste Analyse bisher ALLE auf die protein-Ebene, durch das Studium, die Tätigkeit in über 8.000 Gene und Proteine. Die Ergebnisse zeigen abweichende Faltung der DNA-string, die wiederum Einfluss auf die Gene, die die Aktivität. Die Studie wurde kürzlich in “Nature Communications”.

Etwa 25 Prozent der Kinder zu entwickeln, die ALLE haben eine form der Leukämie, das geprägt ist von den Kranken Zellen mit zu vielen Chromosomen, bekannt als hyperdiploidy. Manchmal bis zu 67 Chromosomen gefunden werden, in einer einzelnen Zelle.

“Wir haben zuvor gezeigt, dass die Gene auf dem extra-Chromosomen Kontrolle der Entwicklung von Leukämie durch immer mehr aktiv. Dies führt zu einem Ungleichgewicht in den Zellen, welche, zum Beispiel, kann dann beginnen, teilen Sie sich schneller”, sagt Kajsa Paulsson, associate professor an der Lund University und der Letzte Autor der Studie.

Jedoch, die genauen Mechanismen bei der Arbeit zu haben, war unklar, bis jetzt. In der neuen Studie untersuchten die Forscher die Aktivität in mehr als 8.000 Genen und Proteinen, die—etwas, das noch nie zuvor getan worden auf dieser Skala für diese form von Krebs.

Der Vorteil der Untersuchung der Proteine ist, dass Sie biologisch relevant. Wenn nur der RNA-Ebene untersucht und dann übersetzt, um die protein-Ebene, die Verbindung ist nicht ganz klar, erklärt Kajsa Paulsson.

“Es ist ein neueres Feld und die Untersuchung der protein-Ebene ist schwieriger, aber der Vorteil ist, dass es gibt uns ein besseres Bild davon, wie die Zelle kontrolliert wird, verglichen mit der nur das Studium der Gene”, sagt Janne Lehtiö, professor am Karolinska Institutet und co-Autor der Studie.

In der hyperdiploid Leukämien, die Forscher stellten fest, die unteren Ebenen der CTCF-protein-und protein-Komplexes cohesin, die kontrollieren, wie die DNA-string ist gefaltet in der Zelle, im Vergleich mit den Leukämien, die keine extra-Chromosomen. Die Forscher haben daher untersucht, wie die DNA gefaltet in hyperdiploid Leukämie und konnten beobachten, dass ein Teil der Fälle zeigten aberrante Falten.

“Wie die DNA gefaltet wird, ist wichtig für die Regulierung, Wann Gene aktiv werden oder nicht. Wir konnten auch sehen, dass die hyperdiploid Leukämien zeigte Anzeichen von falsch reguliertes Gene, etwas, das wahrscheinlich trägt zum Ausbruch der Krankheit”, sagt Paulsson.

Die Fortsetzung der Forschung wird sich darauf konzentrieren, den Anteil der DNA, zeigt abweichende Faltung. Die Ergebnisse der Studie sind wichtig für das Verständnis, wie hyperdiploid kindheit Leukämie entsteht und was treibt der Krebs-Prozess.