Ein tumor ist oft aus verschiedenen Zellen, von denen einige haben sich verändert—oder entwickelt—über die Zeit und gewann die Fähigkeit, schneller zu wachsen, länger zu überleben und potenziell vermeiden Behandlung. Diese Zellen, die haben einen “evolutionären Vorteil”, sind dazu gedacht, zu bewirken, dass die überwiegende Mehrheit der Todesfälle durch Krebs, aber Forscher haben nun ein neues Werkzeug im Kampf gegen tumor-evolution: TrackSig.
TrackSig—entwickelt von Quaid Morris, professor für computer science und molekulare Genetik an der Donnelly Centre for Cellular and Biomolecular Research, und sein team von der Vector-Institut und OICR—ist eine neue computergestützte Methode, die Karte Krebs ist die evolutionäre Geschichte aus einer einzigen patientenprobe und die wiederum helfen den Forschern Strich durch die Krankheit den nächsten Zug.
“Wir Sequenzierung kombiniert mit der evolutionären Theorie und der mathematischen Modellierung zu verstehen, wie Krebs entwickeln und anpassen zu widerstehen Behandlung,” sagt Julia Rubanova, Ph. D.-Kandidat in der Morris-Labor und führen Autor der Studie. “Dieses Verständnis bildet die Grundlage für uns, um in der Lage sein zu voraussagen—und verhindern tumor-evolution in der Zukunft Krebs-Patienten.”
TrackSig wurde heute veröffentlicht in Nature Communications, neben knapp zwei Dutzend anderen Publikationen in der Natur und die Ihr angeschlossenen Zeitschriften im Zusammenhang mit der Pan-Krebs-Analyse Ganzer Genome-Projekt, auch bekannt als Pan-Krebs-Projekt oder PCAWG.
“Die Werkzeuge und Erkenntnisse aus der Pfanne-Krebs-Projekt, die Art ändern, wie wir über Krebs nachzudenken,” sagt Morris. “Wir haben dabei neue Möglichkeiten zur Verbesserung der Diagnose und Behandlung, und wir werden weiterhin darum bemüht sein, immer die beste Behandlung für Patienten zur richtigen Zeit.”
Frühere tumor-evolution der Studien konzentriert sich auf die Identifizierung der häufigsten änderungen—oder Mutationen—in einem Patienten, der Probe, wo die häufigsten Mutationen stellen änderungen, die kamen früher in der tumor-Entwicklung und weniger häufige Mutationen repräsentieren mehr die jüngsten änderungen. Stattdessen Morris’ TrackSig charts verschiedenen Arten von Mutationen über die Zeit, die Generierung von Karten für einen tumor, ist die evolutionäre Geschichte in feinere Details und mit größerer Präzision als je zuvor.
Diese Ebene der Auflösung aktiviert die Entdeckung, dass viele Krebs-verursachende genetische änderungen, die auftreten, lange bevor die Krankheit diagnostiziert wird.
“Für außergewöhnliche Fälle, wie in bestimmten Eierstockkrebs, wir waren in der Lage, um zu sehen, diese frühen Ereignisse von 10 bis 20 Jahren, bevor der patient hat keine Beschwerden”, sagt Lincoln Stein, Leiter der Adaptive Onkologie bei OICR und Mitglied des Pan-Krebs-Projekt-Lenkungsausschuss. “Dies eröffnet ein viel größeres Zeitfenster für Früherkennung und-Behandlung als wir für möglich gehalten hätten.”
