In den fast 20 Jahren seit dem Human Genome Project abgeschlossen wurde, Experten in der genetischen Varianten haben zunehmend Bedenken im Hinblick auf die überbetonung auf das Studium des Menschen europäischer Herkunft bei der Durchführung von großen bevölkerungsstudien. Eine Studie erscheinen 31. Oktober in der Zeitschrift Cell zielt auf einige dieser Unterschiede durch die Fokussierung auf die Populationen Leben im ländlichen Uganda und zeigt so, dass mehrere neue genetische Varianten im Hinblick auf die menschliche Gesundheit.
“Diese Studie unterstreicht die hohe Vielfalt in der afrikanischen Bevölkerung, die bleibt unentdeckt trotz der großen zahlen von gen-Sequenzen generiert wurden, von den Europäern”, sagt co-senior-Autor Manjinder Sandhu, die Studien genomic diversity an der Universität von Cambridge in Großbritannien. “Wir fanden, dass mehr als ein Viertel der genetischen variation, die wir beobachteten in der ugandischen Bevölkerung hatte nicht entdeckt worden.”
Die Teilnehmer der Studie kamen aus 25 Dörfern im ländlichen Teil von südwestlichem Uganda. In Blutproben, die Ermittler generierten Genotypen von über 5.000 Einzelpersonen und durchgeführt whole-genome-Sequenzierung auf etwa 2.000 Personen. Die Forscher sammelten Informationen über elektronische Fragebögen; durchgeführten physikalischen Messungen, wie Blutdruck, Körpergröße und Gewicht; getestet und die Blutproben für medizinisch wichtige Marker wie Cholesterin und glucose.
Die Ermittler mehrere Ergebnisse in Bezug auf genetische Varianten und Gesundheit. “Wir fanden viele neue Assoziationen mit Blut Züge, Leber-Funktion tests, und glucose-related traits,” Sandhu sagt. “Die meisten von Ihnen beziehen sich auf genetische Varianten, die entweder eindeutig zu Afrikanern oder selten in nicht-Afrikaner. Sie können nicht leicht entdeckt, auch in sehr großen Studien, die von nicht-afrikanischen Bevölkerung.”
Speziell fanden Sie, dass die Höhe ist weniger genetisch bestimmt unter der ländlichen Bevölkerung Ugandas relativ zu was ist gesehen worden in Europa-Studien. Im Gegensatz dazu, den LDL-Cholesterinspiegel scheinen eher genetisch bestimmt, die relativ zu den Europäern.
“Wir denken, dies könnte beziehen sich auf Unterschiede in der Wirkung von Diät und Ernährung relativen genetischen Einflüssen zwischen den afrikanischen und europäischen Bevölkerungen”, sagt co-Erstautor Deepti Gurdasani, ein career development fellow an der Queen Mary University of London. “Zum Beispiel, die genetischen Einflüsse auf die Höhe könnte mehr sein, begrenzt durch Unterernährung in der frühen kindheit, die in diesen Populationen. Auf der anderen Seite, den sogenannten westlichen Ernährungsgewohnheiten möglicherweise einen geringeren Einfluss auf den Cholesterinspiegel, wodurch diese mehr genetisch bestimmt.”
Die Forscher fanden auch eine Assoziation zwischen einer genetischen Variante, die bewirkt, dass alpha-Thalassämie unter Afrikanern und glykierte Hämoglobin. Diese genetische Variante, gefunden in 22% der Afrikaner, schützt gegen schwere malaria. Es ist selten in Populationen, in denen malaria nicht endemisch. “Weil glykiertes Hämoglobin wird Häufig verwendet, um diagnose von diabetes, ist dieses Ergebnis deutet darauf hin, dass es Bedarf einer sorgfältigen Evaluierung als test für diabetes in der jeweiligen Bevölkerungen,” sagt co-senior-Autor Ayesha Motala, der KwaZulu-Natal Universität in Südafrika.
Die Studie ergab auch wichtige Erkenntnisse über die menschliche Geschichte und migration. “Uganda ist ein Schmelztiegel der verschiedenen Kulturen und Sprachen, und wir wollten verstehen, die genetische Struktur und Geschichte der Populationen innerhalb des Landes”, sagt Pontiano Kaleebu, der Direktor der Uganda Virus Research Institute und Direktor des MRC/UVRI & London School of Hygiene and Tropical Medicine Uganda Research Unit, die co-Leitung des Projekts. “Diese Studien markieren die umfangreiche Bewegung und Bevölkerung Erweiterungen, die stattgefunden haben in und in Afrika über die letzten paar tausend Jahre.”
Die Analyse ergab, dass die Genome der Ugander sind ein Mosaik aus vielen ancestries, wahrscheinlich spiegelt die umfangreiche migration aus den umliegenden Regionen, die sich über Hunderte bis Tausende von Jahren. Es zeigte sich auch, dass bedeutende Eurasian ancestry eingegeben hat, die region zu mehreren Zeitpunkten, angefangen von ein paar hundert Jahren auf etwa 4.000 Jahren.
Obwohl die Forscher neue genetische Varianten im Zusammenhang mit der Krankheit, Sie sagen viel mehr Forschung ist notwendig, um zu verstehen, wie diese genetischen Varianten beeinflussen die Erkrankung Merkmale. Dies erfordert nicht nur einen Blick auf Genome, sondern auch auf funktionale Effekte von genomen auf die gen-expression und protein-Ebene.
In der Zukunft, Sie planen auch, zu betrachten, Individuen aus anderen teilen von Afrika, insbesondere für die indigenen Jäger-und-Sammler-Populationen, wie die Khoe-San-Bevölkerung in Namibia und Süd-Afrika und den Regenwald Jäger-und-Sammler-Bevölkerungen in zentral-Afrika.
