Bis jetzt haben Forscher geglaubt, dass wiederkehrende Mutationen (hotspot-Mutationen) bei Krebs-Tumoren waren die wichtigen Mutationen (driver-Mutationen) auf das fördern von cancer progression. Eine neue University of California, Irvine-geführte Studie zeigt, ist dies nicht immer wahr.
Methoden zur Identifizierung von Treiber-Gene wichtig, um Krebs Fortschreiten haben, verlassen Sie sich auf die gold-standard-Rezidiv gegenüber Patienten. Das sehen genau die gleichen DNA-Basenpaar mutiert immer wieder über die vielen Patienten wurde als Beweis dafür, dass die mutation muss ein Beitrag zur tumor-Entwicklung. Allerdings, so die Studie, “Passagier-hotspot-Mutationen in der Krebs-angetrieben durch APOBEC3A und Meso-genomische Funktionen”, die heute veröffentlicht in der Wissenschaft, deckt viele wiederkehrende Krebs-Mutationen sind wahrscheinlich Passagier-hotspot-Mutationen und nicht wichtig für die Krebs-Entwicklung.
“In unserer Studie haben wir festgestellt, dass bestimmte wiederkehrende Mutationen in DNA-stem-loops, eine gemeinsame DNA-Struktur, waren in der Tat die PKW-hotspots und nicht die Treiber, die wir ursprünglich glaubten, dass Sie zu sein.”, sagte Rémi Buisson, PhD, assistant professor in der Abteilung für Biologische Chemie an der UCI School of Medicine und der leitende Forscher der Studie. Noch wichtiger ist, entdeckten wir die anderen rekurrenten Mutationen, gefunden, die in der DNA-Standorten außerhalb des stem-loops, werden möglicherweise neue Treiber sind noch nicht charakterisiert. Die Bedeutung unserer Entdeckung ist, dass es gibt uns die Fähigkeit, zu unterscheiden zwischen Mutationen, die notwendig ist, um die Entwicklung neuartiger Krebstherapien.”
Research-teams von der UCI School of Medicine und dem Massachusetts General Hospital untersuchten die mutation, die Landschaft und die Verteilung der Mutationen in der Krebs-Genome von mehr als 9.000 Patienten Tumoren. Sie erkannten, dass bestimmte hotspot-Mutationen entstehen, die aus der Aktivität einer Familie von Proteinen namens APOBEC (apolipoprotein B mRNA-editing catalytic polypeptide-like).
“Unsere Analysen zeigen, dass APOBEC3A, insbesondere, hat eine starke Präferenz für die DNA-Strukturen genannt stem-loops oder DNA-Haarnadeln. Diese Vorliebe führt bei der Erstellung von hotspot-Mutationen in Patienten Tumoren”, sagt Buisson.
Zehntausende von DNA-Schäden treten Ereignisse täglich in menschlichen Zellen. Die APOBEC Familie von Proteinen sind eine der häufigsten Quellen von endogenen DNA-Schäden Ereignisse in Krebs Zellen. APOBEC3A direkt Angriffe genomische DNA, Induktion von DNA-Doppel-Strangbrüchen und Mutationen. Bis jetzt war wenig darüber bekannt, wie APOBEC3A Ziele genomischer DNA und wenn einige Strukturen des Genoms sind anfälliger für APOBEC3A Angriffe als andere. DNA-stem-loop-Strukturen transient generiert, während der DNA-Replikation, Transkription oder durch verschiedene DNA-Reparatur-Prozesse. Diese verschiedenen Wege bieten viele Möglichkeiten für APOBEC3A zur Förderung der Struktur-spezifischen Cytosin-desaminierung begünstigt die Entstehung von Passagier-hotspot-Mutationen in Patienten Tumoren.
Diese Studie wurde unterstützt durch Zuschüsse aus dem National Institutes of Health, einem National Institutes of Health Pathway to Independence Award und die Finanzierung der vom Massachusetts General Hospital Center für die Krebsforschung.
